土曜日のゆとりある時間を生かし、生徒一人ひとりが興味・関心ある事柄を1年間に渡ってじっくり探究するのが自学自修プロジェクト。自分の意思で学んでいくことで、個性の伸長を図ります。先輩の優秀作品も参考にしながら自分のテーマを決め、研究の成果をレポートなどにまとめて発表します。音楽や小説などの創作活動を行ったり、ボランティア体験をまとめたりする生徒もいます。

甲南にはさまざまな分野の第一線で活躍するOBがおり、その人材も豊富で幅広いネットワークがあります。そこで年2回OBを招き、いくつかのグループに分けてワークショップを開催。仕事のことはもちろん、中高時代に学んだことで社会に出てから役立ったことや、OBの方の甲南時代を熱く語っていただきます。実体験から来る話を耳にすることで、将来に向けての意識が高まります。

自らの興味・関心を追求し、主体的に学ぶ力を身につけるために、高校2年生・3年生を対象に実施。「国際」「環境」「経済」「経営」「法」「社会問題」のカテゴリーの中から自分でテーマを設定し、研究を進めます。文献やインターネットによる調査にとどまらず、校外にフィールドワークへ出かけ、実際の現場での取材や聞き取りを行います。また、学んだことを他の生徒と共有するために、研究成果のプレゼンテーションを行います。

長期留学・短期留学・語学研修・クラブ間交流など、甲南では海外での体験を積む機会を数多く設けています。卒業を遅らせることなく（原級することなく）、1年間留学することができ、さまざまな文化にふれながら視野を広げる絶好の機会です。また、交換留学生も積極的に受け入れており、学校生活の中にも国際交流を始める環境があります。

通常の授業では行えない、より本格的で専門性の高い実験や実習に、高校2年生の夏休みを活用してじっくりと取り組みます。少人数のグループに分かれ、物理・化学・生物・地学・数学・情報の分野から選択。甲南大学の教員のサポートを得て大学の施設で進める実験や、臨海学習に行き自然の中で行う実習などを通して科学的好奇心を高め、大学での専門的な学びにつなげます。

法学、経済学、心理学、情報学など大学での専門科目の入門となるものを高校時代に学び、大学入学後の基礎的素養の育成を図ります。甲南大学法学部、知能情報学部、会計大学院などの教員による授業をはじめ、裁判官、弁護士、検察官による授業や、大学でのゼミ見学、模擬裁判、研究室訪問など、高大が連携・融合して一人ひとりの才能を中高時代からじっくりと育成し、強く明確な目的意識をもった大学進学を目指します。